Episome , בתחום הגנטיקה, הוא מולקולת DNA כי הוא יכולת שכפול עצמאי בציטופלסמה של התא המארח, וכי משולבת פיזי של כרומוזום התא המארח, גם משכפל כמו מולקולה יחידה (ב שאנו מכנים שילוב).
אפוא, ניתן לפרש את הפרק כסוג של דו קיום, ולא כסוג של העתק. למעשה, עבור חלק מהכותבים ניתן לשקול טרנספוזונים ורצפי החדרה לפרקים, מכיוון שהם מועברים בפועל על הכרומוזום של התא המארח, למרות שלעולם אין להם קיום עצמאי ואוטונומי בציטופלזמה.
בתאים אוקריוטים, לעומת זאת, אפיזם מתייחס יותר לשכפולים ויראליים המתקיימים בכפיפה אחת כפלסמידים בתאים נגועים מאשר לנגיפים שיכולים להשתלב בגנום של התא המארח.
זה לא המקרה היחיד שבו אותה מילה פירושה דברים שונים באוקריוטות ופרוקריוטות (למשל, המונח טרנספורמציה). לפרקים היסטוריה עשירה בהתפתחות הגנטיקה המודרנית, מכיוון שהם סייעו בפתיחת תופעות מעניינות הקשורות לתורשה.
פרקים שהם חיידקים
אחת הדוגמאות הידועות ביותר לאפיזודות היא של גורם הפוריות, או פלסמיד F. לפעמים, תלוי בהרכב הנוקלאוטידים של החיידק המארח (למשל E. coli), הפלסמיד המעגלי משלב מחדש עם אתרים הומולוגיים המצויים בכרומוזום. של החיידק המוליד קו-אינטגרציה.
כלומר, הפלסמיד יכול לשכפל במספר עותק נמוך בציטופלזמה של החיידק, או אם הוא משולב, יש לשכפל בכללותו במספר עותק המתאים לזה של החיידק ללא F (בדרך כלל אחד).
במצב התרחשותו, F מעניק לחיידקים את היכולת לייצר מספר גבוה של רקומביננטים לאחר תהליך ההתייחדות.
חיידק F + (כלומר, שיש לו פלסמיד F אוטונומי) שעובר החדרת יסוד זה, נאמר שהוא Hfr (לתדר גבוה של רקומבינציה, עבור ראשי תיבות שלו באנגלית), מכיוון שאירוע מצומם הוא תיאורטי. המסוגל "לגרור" את כל הכרומוזום החיידקי לחיידק F (כלומר חסר גורם הפוריות, או פלסמיד F).
באופן כללי, הרצפים המספקים את ההומולוגיה (ולכן, דמיון והשלמה) בין פלסמיד ה- F לכרומוזום החיידקי כך שמאומת את תהליך הרסומבינציה הספציפי לאתר שמוליד את הקואינטגרציה הם רצפי הכניסה.
פרקים בתאים אוקריוטיים
מסיבות היסטוריות, המונח אפיזודה (מעל + גוף) תמיד היה קשור לזה של פלסמיד, שמקורו במקור מעולם האלמנטים החוץ-כרומוזומליים בפרוקריוטים.
כשאתה מוצא אלמנטים דומים באיקריוטות, השימוש בהם אומץ לייעד מולקולות של גנום ווירוסים המסוגלים לשכפל עצמי בסוג זה של תאים נגועים עם תכונות שהיו דומות לאלו של פלסמידות בפרוקריוטות.
כלומר, בתאים אוקריוטיים הנגועים בנגיפים, אנו יכולים למצוא במקרים מסוימים שכחלק ממחזור המשכפל שלו, הנגיף מתקיים בתא כמולקולת DNA מעגלית הדומה לשכפולים האחרים המתוארים, למשל, בחיידקים.
הנגיפים הנפוצים ביותר שיכולים להתקיים בדו-קיום כמולקולות DNA מעגליות (מתוך הכרומוזום המארח) שייכים זה לזה למשפחות Herpesviridae, Adenoviridae ו- Polyomaviridae.
אף אחד מהם אינו משולב בגנום המארח, וזו הסיבה שניתן לשקול שהם משכפלים כפלסמידים ושהם אינם עומדים בתכונה המהותית המאפיינת אפיזודה: להשתלב בגנום המארח.
למרות שהוצע הסרת המונח, אולי זה רק יוסיף בלבול לנושא שהוא כבר די מורכב בפני עצמו.
מסקנות
לסיכום, אנו יכולים לומר כי אפיזודה, מבחינה אטימולוגית, הוא יסוד גנטי של שכפול אוטונומי שיכול להתקיים בדו-קיום בתא כמולקולת DNA חופשית, או להשתלב פיזית בזה של המארח.
מבחינת הגנטיקה, לעומת זאת, אפיזודה הוא פלסמיד או וירוס שיכולים להשתלב בגנום הפרוקריוטי, או להיות אחד מסוגי הפלסמידות שתא אוקריוטי יכול להכיל.
מעניין שוירוסים שיכולים להכניס לגנום של המארח האוקריוטי (רטרו-וירוס) אינם נחשבים לאפיזודות.
הפניות
- ברוק, TD 1990. הופעתם של גנטיקה חיידקית. עיתונות המעבדה בקור ספרינג הארבור. קולד ספרינג הארבור, MA, ארצות הברית של אמריקה.
- Griffiths, AJF, Wessler, SR, Carroll, SB & Doebley, J. מבוא לניתוח גנטי. WH Freeman & Co, McMillan מוציאים לאור. לונדון, הממלכה המאוחדת.
- הייז, וו. 1971. הגנטיקה של חיידקים ווירוסים שלהם, מהדורה שנייה. פרסומים מדעיים של בלקוול.
- Jacob, F. & Wollman, EL 1958. פרקים לס, יסודות génétiques ajoutés. מגיעה Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154–156.
- לוי, JA, Fraenkel-Conrat, H. & Owens, OS 1994. Virology, מהדורה שלישית. אולם פרנטיס. צוק אינגלרווד, ניו ג'רזי, ארצות הברית.